Mikrobiální ekologie vod

Skupina mikrobiální ekologie vod se dlouhodobě věnuje výzkumu mikrobiálních biofilmů a mikrobiálních procesů zapojených v koloběhu organického uhlíku v tekoucích vodách, zejména ve dnových, tzv. hyporheických sedimentech (viz obr.). Tyto sedimenty jsou hlavním metabolickým centrem tekoucích vod, kde dochází k rozkladu a transformaci organických látek a živin. Kromě jiného zde dochází k produkci plynů, které mají výrazný radiační charakter (tzv. skleníkové plyny), jako jsou CO2, CH4 a N2O. Současný výzkum je zaměřen na studium prostorové distribuce metanogenních a metanotrofních bakterií v hyporheických sedimentech a objasnění rozdílů ve zdrojích substrátů pro metanogenezi a produkci/spotřebě metanu během roku na různých lokalitách v podélném průběhu malého nížinného toku Sitka. K detekci a identifikaci metanotrofních bakterií a metanogenních archeí jsou používány moderní molekulární metody jako FISH (fluorescenční hybridizace in situ), PCR, DGGE, klonování genů a sekvenace. Při objasnění mechanismu vzniku a koloběhu metanu v sedimentech a vodním sloupci vycházíme z analýzy stabilních izotopů 13C/12C v plynných vzorcích metanu.

 

Odběr vzorků hyporheických sedimentů metodou freeze core přímo ve vodním toku

Odběr vzorků hyporheických sedimentů metodou freeze core přímo ve vodním toku